Есть опция запуска внешних приложений до и после задачи и даже с вариантом ожидания. На старте и на выходе из гибернации я внешний винт отключаю через программку USB Safety Remove через планировщик с 25 сек задержкой, чтобы не шуршал под ухом.
Команда: usr forcedstop -d j: (где J - это имя диска.)
Остановленный диск можно и разбудить: usr.exe return -d j:
С командной строки работает превосходно, прописал в батники, и там с энтера всё работает.
Логично это использовать для старт/стоп J до и после бекапа с задержкой на выполнение. Ни батники, ни команда не работает. Даже попыток отработать команду нет хоть путь в кавычках хоть нет.

27.07.2017 0:25:16 <<< Starting the task.
27.07.2017 0:25:16
27.07.2017 0:25:16 Launching the external application ""C:\Program Files (x86)\Exiland Backup Professional\cmd\start_J.cmd"" under the "NT AUTHORITY\LocalSystem" account
27.07.2017 0:25:16 Waiting for the external application to finish (maximum 30 seconds) ...
27.07.2017 0:25:17 Execution of the external application has been completed
27.07.2017 0:25:17 Pause: 10 seconds
27.07.2017 0:25:17
27.07.2017 0:25:27 Error: The disk "J:\" is not accessible.
27.07.2017 0:25:27
27.07.2017 0:25:27 Error: The backup has not been created.